单细胞RNA测序揭示腹主动脉瘤的细胞亚群异质性
本研究通过单细胞测序确定单个细胞水平上的转录结果，研究发现，与对照组主动脉相比，单细胞测序弹性蛋白酶诱导的AAA表现为平滑肌细胞数量减少，免疫细胞增加。平滑肌细胞的亚群分析在对照组和AAA样本中都发现了四个亚群。一个特定的亚簇在应用弹性蛋白酶14天后明显增加，这被认为是AAAs的进展的提示。然后通过对平滑肌细胞亚群进行特定的基因特征分析。研究者发现，AAAs平滑肌细胞中的收缩基因，如Myh11和Tagln减少，而几个细胞因子的mRNA则增加，包括Cxcl2和Ccl2。在发病14天后，平滑肌细胞亚群中Thbs1和Notch3的含量很高，其在AAA的形成中发挥了关键作用，而且值得注意的是，白细胞介素10在这个独特的集群中含量很高。这些结果与AAA组织中平滑肌细胞和巨噬细胞的表型转换一致，以上结果为AAA形成的细胞特异性机制提供了新的见解。 腹主动脉瘤(AAAs)对公众健康具有严重威胁尤其是在老龄化加重的社会中，然而目前还没有任何有效的药物治疗方法来抑制该疾病的进展。因此，医学上迫切需要确定AAA的分子机制，以促进新型药理学方法的开发。近来研究表明，AAA组织包含许多不同的细胞类型，这些细胞可能有多个主要类别的亚型。与Bulk-RNA测序相比，单细胞RNA测序(scRNAseq)是一种非常有潜力的技术，其可以确定细胞水平的转录组基因谱;通过scRNAseq进行全面和无偏倚的基因分析，可以更好地了解生理和病理生理条件下的细胞特定分子特征。自2010年左右报道scRNAseq技术以来，该技术的使用已急剧增加，改进的scRNA数据分析工具，包括各种分析包程序，极大地促进了scRNAseq的应用。由于scRNAseq是在单细胞水平上进行剖析，因此在这个水平上确定基因丰度是scRNAseq的一大优势。然而scRNAseq测序的一个主要的缺陷是缺乏组织内细胞信息的空间分布。细胞和其组织之间的位置关系对理解疾病过程非常重要。因此，经典的方法，如免疫染色和原位杂交，仍然是阐明空间分布的重要手段。
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