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急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合症(MDS)是两种严重的恶性血液肿瘤,快速全基因组测序堪称血液科治疗上的“两座大山”,约1/3的MDS患者可发展为AML。 虽然近些年来AML和MDS在治疗方面取得一定进步,有化疗、支持治疗、造血干细胞移植、靶向/免疫疗法等,但究竟哪一种方案最有效,仍是临床治疗上一大难题。 加上这两种血液病的患者多为中老年人,年龄和身体情况都不允许过多的“折腾”,精准选择有效的疗法十分重要。 近日,《新英格兰医学杂志》上的一篇研究表明:使用全基因组测序来鉴定其肿瘤细胞的基因组变化,可以帮助医生为AML或MDS患者选择最佳治疗方案。 一、全基因组测序,这些优势不能复制! 目前,恶性血液肿瘤,如AML或MDS,基因组异常事件发生率较高,基因检测已得到广泛应用。 虽然突飞猛进的测序技术也提高了识别基因突变的能力,但常规细胞遗传学分析仍是患者诊断检查的重要组成部分,可确定染色体重排。 不过,细胞遗传学分析需要用到患者的活细胞,这就需要骨髓活检;而且还有灵敏度低和分辨率有限等局限性。 因为,在多达20%的患者中,肿瘤细胞不会生长,或无法通过观察足够的染色体来做出判断。同时,还有一些基因变化太小,无法通过细胞遗传学分析看到。 而全基因测序可对患者的全面基因组进行分析,且不需要活细胞,仅使用患者癌细胞中少量的DNA样本。因此,有望克服这些局限,甚至成为一种常规的检测方法。 与常规基因检测相比,全基因组测序更全面、更精确! 研究人员开发了一种简化的全基因组测序方法对整个基因组进行测序并分析患者样本中的数据。 临床研究一共获得了263位髓样癌患者的基因组概况,其中包括235位已经成功进行细胞遗传学分析的患者,可以代表AML和MDS广泛的遗传学体征。 通过对这些基因进行测序和分析,并将得到的结果与细胞遗传学分析和靶向测序的结果进行比较。 结果发现,全基因组测序可以检测出通过细胞遗传学分析检测到的所有染色体变化。更重要的是,在235名患者中,17%的患者发现了其他染色体变化,其中一些患者的常规检测结果尚无定论。
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