ningxueqin 发表于 2024-5-18 15:13:39

生物标志物分析Taq DNA聚合酶

  生物标志物分析模板
  (1)PCR反应必须以DNA为模板进行扩增, 模板DNA可以是单链分子,也可以是双链分子,可以是线状分子,也可以是环状分子(线状分子比环状分子的扩增效果稍好)。
  (2)就模板DNA而言,影响PCR的主要因素是模板的数量和纯度.一般反应中的模板数量为102 -105 个拷贝,对于单拷贝基因,这需要0.1μg的人基因组DNA,10ng的酵母DNA,1ng的大肠杆菌DNA.扩增多拷贝序列时,用量更少。
  (3)灵敏的PCR可从一个细胞,一根头发,一个孢子或一个精子提取的DNA中分析目的序列。
  (4)模板量过多则可能增加非特异性产物。DNA中的杂质也会影响PCR的效率。
  5.Taq DNA聚合酶
  一般Taq DNA聚合酶活性半衰期为92.5℃ 130 min,95℃ 40 min, 97℃ 5 min。现在人们又发现许多新的耐热的DNA聚合酶,这些酶的活性在高温下活性可维持更长时间。
  Taq DNA聚合酶的酶活性单位定义为74℃下,30 min,掺入10 nmol/L dNTP到核酸中所需的酶量。Taq DNA聚合酶的一个致命弱点是它的出错率,一般PCR中出错率为2×10-4 核苷酸/每轮循环,在利用PCR克隆和进行序列分析时尤应注意.在100 μl PCR反应中,1.5-2单位的Taq DNA聚合酶就足以进行30轮循环。
  所用的酶量可根据DNA、引物及其它因素的变化进行适当的增减.酶量过多会使产物非特异性增加,过少则使产量降低。
  反应结束后,如果需要利用这些产物进行下一步实验,需要预先灭活Taq DNA聚合酶, 灭活Taq DNA聚合酶的方法有:
  (1)PCR产物经酚:氯仿抽提,乙醇沉淀。
  (2)加入10 mmol/L的EDTA螯合Mg2+ 。
  (3) 99-100℃加热10 min。目前已有直接纯化PCR产物的Kit可用。
  6.反应缓冲液
  (1)反应缓冲液一般含10-50 mmol/L Tris·Cl (20℃下pH8.3-8.8), 50 mmol/L KCl和适当浓度的Mg2+ 。Tris·Cl在20℃时pH为8.3-8.8,但在实际PCR反应中,pH为6.8-7.8. 50 mmol/L的KCl有利于引物的退火。
  (2)反应液可加入5mmol/L的二硫苏糖醇(DDT)或100 μg/ml的牛血清白蛋白(BSA),它们可稳定酶活性,另外加入T4噬菌体的基因32蛋白则对扩增较长的DN**段有利。
  (3)各种Taq DNA聚合酶商品都有自己特定的一些缓冲液。
页: [1]
查看完整版本: 生物标志物分析Taq DNA聚合酶